和大多数园艺植物一样，牡丹品种演化遵循着一定的规律，同时又有着自身的特点，不同的自然条件和栽培条件，以及品种选育过程中人们不同的审美价值取向，也影响或制约着品种演化的方向和进程。

品种演化过程与演化程度。与各地自然条件、栽培条件关系密切。不同品种群间花色的分化、色素构成以及鲜艳程度，是各地气候、土壤中所含元素等条件综合影响的结果。品种作为人工选育的产物，其形成与发展演化，不仅受到自然条件的影响，也受到培育者审美情趣及价值取向的制约。

关于牡丹品种的形成与演化过程，可分为以下6个阶段：

1、野生种引种驯化阶段  最早的牡丹品种选育方法，如在隋、唐或更早，主要是引种驯化原始状态的野生种，野生种通过人工引种栽培，环境条件优越了，改变很大，迅速产生变异。

2、芽变（芽条变异）选种阶段  主要从唐宋开始，这一阶段除继续用野生种引种驯化外，又开始利用芽条变异以嫁接的方法进行选育。

3、实生选种（天然授粉种子实生选育）阶段   此时除继续前二法外，又出现了利用播种自然授粉种子的方法，从实生苗中来选择并培育新品种。此法始之南宋，至明清两代而广泛应用，至今犹然。

4、人工授粉选育阶段   除了仍用前三法外，还进行人工授粉、人工辅助授粉来选育新品种。此项工作开始较晚，新中国建国后开始应用。

5、有计划杂交阶段  我国开始于上世纪50年代中期，发端于北京故宫博物院。

6、远缘杂交育种结合人工引变等新技术阶段   利用野生种与现代新品种结合胚育、辐射诱变等新技术，把胚育牡丹新品种的水平推向新高度。

牡丹品种的色彩比较丰富，但还缺少纯兰、纯绿和纯红（或称大红、朱红）的品种，从事牡丹品种研究的科学工作者正朝着这一育种目标不懈努力着。